挖基础土方

某工程是独立柱基础，基础深度是1.95米,室内外高差是0.45米,
在审计某工程中遇到以下问题：
施工单位在开挖基础后发现,与地堪报告不符合,出现了大量的直径为1米左右的卵石.给开挖造成难度.施工单位的技术经济签证核定单如下
1机械大开挖至-1.85,放坡为1:1.5
2.-1.85至-2.85米是超深部份,为人工清理石头(超深原因不明)
a机械挖石方XXXm3 , b人工凿石方量XXXm3 , c机械,人工挖石头转运距:1.5公里.

在招标文件工程量清单编制时，挖基础土方（深度2米以内），项目特征描述是：1。土壤内别：综合土石比 2。基础类型：综合考虑 3。挖土深度：深度2米以内 4。弃土运距：投标人自行考虑，综合在投标单价中 5．挖土方式：投标人自行考虑，综合在投标单价中 6。人工捡底：投标人自行考虑，综合在投标单价中
施工单位的挖基础土方投标报价(综合单价)是11.22元/立方
施工单位的竣工结算报价是按基础大开挖, 计算计量时含有工作面和放坡.清单项目有a机械挖石方 b人工凿石方量 c机械,人工挖石头转运距:1.5公里.其单价是按挖石方重新组价.
现在是作为一个审计工作人员(工程造价)应该如何计算才合理.