投加除磷剂沉淀的位置也是有讲究的，实际中常采用的有：前沉淀、同步沉淀和后沉淀。

在沉淀池前投加金属沉淀剂到原水中。其一般需要设置产生涡流的装置或者供给能量以满足混合的需要。

相应产生的沉淀产物(大块状的絮凝体)则在一次沉淀池中通过沉淀而被分离。

如果生物段采用的是生物滤池，则不允许使用Fe2+药剂，以防止对填料产生危害(产生黄锈)。

前沉淀工艺适合于现有污水处理厂的改建(增加化学除磷措施)，因为通过这一工艺步骤不仅可以去除磷，  而且可以减少生物处理设施的负荷。

同步沉淀是使用较为广泛的，其是将除磷剂投加在曝气池出水或二次沉淀池进水中，个别情况也有将除磷剂投加在曝气池进水或回流污泥渠(管)中。

目前很多污水厂都采用同步沉淀，加药对活性污泥的影响比较小。

将沉淀、絮凝以及被絮凝物质的分离在一个与生物设施相分离的设施中进行的方法则是后沉淀。

向出水中投加除磷剂，一般将除磷剂投加到二次沉淀池后的一个混合池中，之后混合沉淀。并在其后设置絮凝池和沉淀池(或气浮池)。

对于要求不严的受纳水体，在后沉淀工艺中可采用石灰乳液药剂，但必须对出水pH值加以控制，比如采用沼气中的二氧化碳进行中和。

采用气浮池可以比沉淀池更好地去除悬浮物和总磷，但因为需恒定供应空气而运转费用较高。