求助：关于替甲方代付工程款如何在决算中显示出来？

我公司去年做了个政府工程，中标价800多万，下浮率是12%.施工过程中由于我工地有一个自来水管道，由当地所在的自来水公司来移走，需要2万元，当时甲方说我公司先垫付，可以签证。今年要做决算的时候我发现这2万元如果在决算中出现的话，那还需要下浮12%，我该怎么弄啊？