热水系统未完全同程， 能通过后期调试达到满意效果？

我在复审单位以前做的一个医院， 规模不算太大， 10层楼，下面3层是裙房，为门诊、医疗，上面是住院部。发现其系统未做到同程设计，有部分管路存在短路现象（主要在门诊部）。由于该工程早已进行到管道安装阶段， 热水管道基本安装完成，如果要改的话，产生的工作量和材料会对公司造成不好的影响；可是不改的话，使用时供热效果真的很难讲啊。
做了这么些年设计，真正现场的调试几乎没参加过，可能本来这些都归施工单位负责吧。我的一个同事倒是碰到过放不出热水的窘境， 甲方叫他去， 琢磨了半天， 后来也不知怎么解决的。希望我没碰到这些事是设计合理的原因。
虽然图纸不是我设计的， 可也不愿意公司日后被甲方质问“你们是怎么做设计的！”
所以想问问， 如果将错就错， 后果会很严重吗？
理论上通过回水管阀门的开启调节是有可能的， 但难度到底多大？ 请各位指教！