钢结构预埋地脚螺栓偏位该如何处理

请教各位大侠预埋地脚螺栓偏位该如何处理？现场具体情况如下：
由于厂房的面积比较大（336米长，134米宽），甲方给点的时候就给了两条轴线，全靠50米大尺拉距离，经纬仪也是老式的J6光学经纬仪！
现在混凝土浇好之后螺栓偏差在1——2cm之内的比较多，最大的偏差达到3cm！甲方是日本人，甲方不允许现场割孔！要求把承台混凝土敲掉重新做！