合同专用条款中互相矛盾如果处理？

在结算时遇到这种情况。
招标时按固定总价招标，招标文件中规定：允许调整合同价款：除设计变更外，均不能调整合同总价。且有写明：中标人中标后28日内与提供也核对工程量清单计算总价，计入总价包干合同，竣工时不再调整。若中标人在规定的日期内未进行工程量清单核对，则视为对原清单无异议，并以此计入合同价。
现 中标人并未与招标人核对。
甲方与乙方签订的施工合同专用条款中 关于合同价款及支付：本合同采用 固定价格合同，允许调整合同价款：除设计变更外，均不能调整合同总价。
但 现在 施工合同中有这样的一条补充条款：因设计变更或招标文件工程量清单错、漏项而引起的工程量的增减按实结算，承包人及发包人不得有任何异议。

那请问这种情况下应该如何办理结算。
是按固定总价，还是按实际发生的工程量结算。？？？