好氧处理和厌氧处理的区别主要有以下几个方面。
(1)起作用的微生物群不同好氧处理是由好氧微生物和兼性微生物起作用的；而厌氧处理是由厌氧微生物和兼性微生物起作用的。
(2)产物不同好氧处理中，有机物被转化为CO2、H2O、NH 3， 或NO z、NO， 、PO、SO等， 产物基本无害， 处理后废水无异臭。厌氧处理中，有机物被转化为CH4、NH3、胺化物或氮气、Hz S等， 产物复杂， 出水有异臭。
(3)反应速率不同好氧处理由于有氧作为受氢体，有机物分解比较彻底，释放的能量多，故有机物转化速率快，在处理设备内的停留时间短，设备体积小。厌氧处理有机物氧化不彻底，释放的能量少，所以有机物转化速率慢，需要的时间长，设备体积大。
(4)对环境要求条件不同好氧处理要求充分供氧，对环境条件要求不太严格。厌氧处理要求绝对厌氧的环境，对环境条件(如pH值、温度)要求甚严。
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常用的废水生物处理方法废水生物处理包括好氧处理和厌氧处理两大类。按照微生物的生长方式，又可以分为悬浮生长型和固定生长型两类。 活性污泥法和生物膜法是目前使用最为广泛的两种生物处理工艺类型。活性污泥法将空气连续通入含有大量溶解性有机物质的废水中，经过一段时间后，在废水中就会产生大量的生物絮体。这些活性污泥微生物以水中的有机物质为营养元素进行生长繁殖。微生物的增长过程中，有机物不断得到降解。生物膜法是将废水连续流经固体填料，由填料上附着的大量微生物对有机物起净化作用。生物膜法可以有不同的类型，包括生物滤池、生物转盘、生物接触氧化及生物流化床等。
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