局部有地下室 基础层

问题补充：局部有地下室（底板面标高-3.65），还有很多不同的独立基础底标高（最深-4.75）然后我楼层建立地下室层高3.6，基础层高1.1.最后我基础层的柱子跑到了独立基础的底下。请问这样要怎么处理？或者我楼层建立错误，要怎么建立才好。