请教一个基础与主体结构划分的问题

这是最近碰到的一个事情，主要是关于框架结构中基础与主体结构划分界面的问题，想请各位高手帮忙解答一下。
基础结构形式为柱下独立基础（承台顶面标高约为-1m），在结构设计总说明中，设计有这样一句话“基础混凝土为C25，柱自基础顶面至5.35m混凝土为C40，其余梁板柱混凝土为C30”，在施工过程中，施工单位将±0.000以下部位（柱及基础联梁）均按照基础混凝土进行施工（C25），并称基础顶面即为为±0.000，±0.000以下均为基础，±0.000均为主体，他们所持的依据主要是《建筑工程施工质量验收统一标准》，监理单位也是这个看法。
我不是学工民建的，但我从受力角度分析，我觉得这是不对的，基础梁都是些连系梁，我认为基础顶面肯定是承台顶面，基础与主体结构应该是以承台顶面来进行划分，在咨询设计后，也得到了肯定的答复，现在存在的问题是，一旦确认基础与主体按承台顶面来进行划分，那就意味着施工单位把混凝土浇错了，这是一项很严重的失误，而且对结构有影响，施工单位和监理是要承担相应责任的，所以他们坚持±0.000才是基础和主体的分界面（他们还认为基础联梁也属于基础，我认为这肯定是错误的），我们甲方和设计都知道应该以承台顶面来进行划分，但是却找不到书面依据，我也上网查了很多资料，也都是众说纷纭，有的说应该以承台顶面划分，也有的说应该以±0.000来进行划分，设计院也说不方便出书面解释，只能进行口头上的沟通。
所以我要咨询的问题是：
（1）在结构设计中，柱基础与主体结构划分的界面究竟是什么（地梁为连系梁的情况下）？ 有没有书面的依据？
（2）目前施工方和监理依据《建筑工程施工质量验收统一标准》对基础和主体进行划分是否站的住脚？（个人认为±0.000仅限于建筑专业使用，对于建筑结构没有太大意义）
（3）诸位是否也遇到过类似的问题，是如何处理这类问题的？（设计院反映他们从来未遇到类似的问题，对于错浇的混凝土，我们还是倾向于看28天强度，如果强度能满足设计要求，可以不进行处理，如果达不到设计要求，是肯定要挖掉重新浇筑的）
再次拜托大家了~~